一、温度效应：软组织之激光切割关键以此效应来完成。组织吸收激光能量后温度会上升，当温度在370C至600C时组织不容易发生改变，一经高于600C时即开始凝固，可做到止血的作用，当温度高于1000C，细胞间的水分会被蒸发，余下脱水的组织高于2000C以上时会被碳化。

二、机械效应：激光切割硬组织的能力并非来于温度效应，反而是藉由能量将组织中的水蒸发，导致组织内压力升高，在硬组织熔点未到达之前就导致组织的破裂，这个现象特称之为微爆发，和温度效应无直接相关。

三、流体动力效应：譬如最新的铒铬YSGG激光，关键为激光激发水分子发生高速动力的流体力学。水分子极易吸收此一波长的激光能量，却不会破坏水分子的键结结构。若其激光能量撞击到水分子，则可使水分子激发变成具有高速动能的状态，此一流体动能便能做到组织激光切割的良好效果，亦是采用水分子作为组织激光切割之媒介。